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求《分子进化与系统发育》

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【书名】分子进化与系统发育
【语言】中文
【出版者】高等教育出版社
【出版地】北京
【出版日期】2002
【作者】(美)Masatoshi Nei，(美)Sudhir Kumar著
【载体形态】299页,23cm
【关键词】分子进化,,系统发育,
【内容摘要】本书是两位作者近四年来的合作成果。本书首先讨论了分析蛋白质和DNA序列数据的统计方法，然后介绍了分析等位基因频率的方法，包括实验室和其他实验室创建的多种新方法。有些方法及其统计特性是在本书撰写过程中研究并且是刚刚发表的，或者是在本书中首次披露的。收录的标准为实用性而非数学上的创新。以合乎生物学现实的假设为依据的统计方法也优先收录。由于第一作者的实验室从事该领域的研究已有30年，而且有些专题主要是在他的实验室进行研究的，所以本书主要收录了这一实验室的许多研究工作。本书中有关序列数据的方法多于等位基因频率数据的方法，这只是因为如今序列数据已远远多于基因频率数据。许多涉及后者的方法已在《分子进化遗传学》作了讨论。其目的是要把当时研究分子水平上进化的两门不同的学科统一起来，一门是重建生物进化历史，另一门则是研究进化的机制。最近十年来，这两个研究领域均已取得显著进展，并且不可分隔。产生这样进展的部分原因是PCR等生化技术的发展使得快速测定DNA序列成为可能。这一技术上的创新使得许多不同生物类群的大量DNA序列数据得以测定，大大加速了研究分子进化遗传学的研究速度。本书得到了美国国立卫生研究院(NIH)和国家科学基金会(NSF)给第一作者的研究资助。本书有一部分是第一作者在日本国立遗传研究所(NIG)作学术休假时撰写的，得到了日本科学促进会(JSPS)的资助。

具体内容有：
第一章、进化的分子基础：生命的进化树；进化机制；基因的结构与功能；DNA序列的突变；密码子使用频率。
第二章、氨基酸序列的进化演变：氨基酸差异和不同氨基酸的比例；泊松校正(PC)和Г距离；自展法的方差和协方差；氨基酸的替代矩阵；突变率和替代率。
第三章、DNA序列的进化演变：两个序列间的核苷酸差异；核苷酸替代数的估计；Г距离；进化距离的数值估计；核苷酸序列的对位排列；进化距离估计中有关序列间隔的处理。
第四章、同义与非同义的核苷酸替代：进化通径方法；基于Kimura双参数模型的方法；密码子3个不同位置的核苷酸替代；用于密码子替代模型的似然法。
第五章、系统发育树：系统发育树的种类；拓扑差异；构树方法。
第六章、系统发育推断——距离法：UPGMA；最小二乘(LS)法；最小进化(ME)法；邻接(NJ)法；用于系统发育重建的距离测度。
第七章、系统发育推断：最大简约法。包括：寻找最大简约(MP)系统树；MP树的搜索策略；一致树；分支长度的估计；加权简约法；用于蛋白质数据的MP法；共享的遗传特征。
第八章、系统发育推断——最大似然法。包括：ML法的计算过程；核苷酸替代模型；蛋白质似然法；ML方法的理论基础；给定拓扑结构的参数估计。
第九章、系统树的精确性和统计检验：最优原理和拓扑结构误差；内部分支检验；自展检验；拓扑结构差异的检验；不同构树方法的优缺点。
第十章、分子钟与线性树：分子钟假说；相对速率检验；系统发育检验；线性树。
第十一章、祖先核苷酸与氨基酸序列：祖先序列推断——简约法；祖先序列推断——贝叶斯方法；祖先分支中的同义与非同义替代；趋同进化和平行进化。
第十二章、遗传多态性和进化：遗传多态性的进化意义；等位基因频率数据的分析；再分群体中的遗传变异；多个基因座位的遗传变异；DNA多态性；检测自然选择的统计检验。
第十三章、用遗传标记构建群体树：等位基因频率数据的遗传距离；限制性酶的DNA序列分析；RAPD数据分析。
第十四章、展望：统计方法；基因组计划；分子生物学与进化。书后附外文参考文献700篇。
【ISBN】7-04-011204-3
【分类号】Q75
【索书号】Q75/NM
【财产号】Z158802

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